Japanagromyza aequalis
Japanagromyza desmodivora
Japanagromyza inaequalis
Japanagromyza nawai – synonym of Japanagromyza tristella
Japanagromyza phaseoli
Japanagromyza spec. – synonym of Japanagromyza phaseoli
Japanagromyza tristella
Japanagromyza variihalterata – synonym of Japanagromyza tristella